Bästa gratis programvara för molekylär modellering för Windows 10

I den här artikeln kommer vi att täcka den bästa gratis programvaran Molecular Modeling(Molecular Modeling software) för Windows 10 PC. Med hjälp av dessa gratisprogram kan du skapa modeller av olika enkla till komplexa kemiska föreningar. Den här mjukvarusamlingen är användbar för studenter inom bioinformatik, kemiteknik, etc. Du kan lägga till olika element från det periodiska systemet(Periodic Table) för att bilda en kemisk förening. Dessutom kan du i denna programvara också se en kemisk förening i olika stilar, som trådram, kula och pinne, rör, kula och cylinder(wireframe, ball and stick, pipes, ball and cylinder) och mer.

Molecular Modeling programvara för Windows 10

Vissa av dessa program innehåller också olika kemiska grupper och strukturer för din bekvämlighet. Välj dem helt enkelt(Simply) så är din kemiska modell klar. Exempel på kemiska grupper inkluderar  alkoholer, bensen, aldehyder, aminosyror(alcohols, benzene, aldehydes, amino acids) , etc. Utöver det kan du också göra kemiska beräkningar som  energi, bindningslängd(energy, bond length) , etc.

  1. Avogadro
  2. MoluCAD
  3. ArgusLab
  4. Ascalaph Designer

Låt oss ta en titt på dem.

1] Avogadro

Bästa gratis programvara för molekylär modellering Avogadro

 Avogadro  är ett utmärkt gratisprogram för molekylär modellering som kommer med massor av funktioner. Dess användarvänliga gränssnitt gör det lätt att förstå för användarna. När du startar programvaran kommer du att se en svart skärm och en panel på vänster sida. Du kan komma åt några vanliga element från rullgardinsmenyn(drop-down menu) på den vänstra panelen. Om du vill komma åt alla element klickar du helt enkelt på " annat(other) " i rullgardinsmenyn, så startar programvaran det periodiska systemet(Periodic Table) . Elementet som du väljer från det periodiska systemet(Periodic Table) kommer att vara tillgängligt i rullgardinsmenyn.

Steg för att rita en kemisk förening:

  1. Välj(Select) ett element från rullgardinsmenyn på den vänstra panelen och klicka på den svarta skärmen för att lägga till det.
  2. Välj nu ett annat element från rullgardinsmenyn.
  3. Tryck och håll ned vänster musklick och dra den till det första elementet för att ansluta det med en kemisk bindning. Du kan också välja typ av kemisk bindning, enkel, dubbel eller trippel.

Det finns olika knappar på verktygsfältet i programvaran:

  • Ritverktyg(Draw tool) : Det låter dig rita olika molekylära föreningar.
  • Navigeringsverktyg(Navigation tool) : Med det kan du flytta, rotera, zooma in och zooma ut den molekylära modellen.
  • Bindningscentriskt manipuleringsverktyg(Bond centric manipulation tool) : Välj det här verktyget och klicka på någon av bindningarna för att se vinkeln.
  • Verktyg för automatisk rotation(Auto rotation tool) : Välj det här verktyget och klicka på knappen " Start ". Nu, tryck och håll ned vänster musklick och dra den i valfri riktning. Släpp vänsterklicket så börjar molekylmodellen rotera automatiskt.

Om du vill ändra storlek på bindningslängden för föreningar automatiskt, gå till " Extensions > Optimize Geometry " eller tryck på " Ctrl+Alt+O ." För att beräkna energin, gå till " Extensions > Molecular Mechanics > Calculate Energy ."

Spara filen(Saving the File) : Du kan spara ditt projekt i flera format, inklusive  PDB, ENT, CHM, ALC, CDXML, CDX, C3D2, C3D1, SD, SDF, DMOL, CHT, GAM . Bortsett från detta finns också ett exportalternativ tillgängligt, med vilket du kan spara ditt projekt i  PDF, SVG, BMP, JPG, PNG , etc.

2] MoluCAD

Bästa gratis programvara för molekylär modellering för Windows 10

MoluCAD  är ett annat gratisprogram för molekylär modellering i den här listan. Precis som Avogadro kommer den också med många funktioner. I den här programvaran kan du se både 2D- och 3D-vyer bredvid varandra. Vissa vanliga element finns tillgängliga på den vänstra panelen i programvaran. För att lägga till det i huvudutrymmet, klicka helt enkelt på något av elementen. Om elementet du vill lägga till inte är tillgängligt där kan du välja det från det periodiska systemet(Periodic Table) . För att se det periodiska systemet(Periodic Table) högerklickar du på det svarta utrymmet och klickar på knappen " Lägg till atom ".(Add Atom)

Steg för att rita en kemisk förening:

  1. Klicka(Click) på något av elementen på den vänstra panelen för att lägga till det.
  2. Klicka(Click) på ett annat element för att lägga till det, eller så kan du välja det från det periodiska systemet(Periodic Table) .
  3. För att ansluta elementen, gå till " Add > Bonds – Connect Atoms " och välj typ av kemisk bindning. Klicka nu på den första atomen och klicka sedan på den andra.

Förutom element kan du också lägga till föreningar. På den högra panelen hittar du olika  molekyler, aminosyror, funktionella grupper, ensamma paratomer(molecules, amino acids, functional groups, lone pair atoms) etc. Välj valfri struktur och dra och släpp den till huvudutrymmet. Du kan beräkna energin hos molekylerna genom att klicka på " Energy > Evaluate Energy ."

Med hjälp av menyn " Fråga(Query) " kan du beräkna  avståndet mellan två atomer, bindningslängd, bindningsvinkel, torsionsvinkel, masscentrum(distance between two atoms, bond length, bond angle, torsion angle, the centre of mass) , etc. Du kan se 3D-strukturen i fyra olika vyer,  topp, fram, sida och sned(top, front, side, and oblique) . Gå till " View > Graphics Mode " för att se modellen i olika former, som  kula och sticka, rymdfyllning, rör(ball & stick, space fill, pipes) och mer.

Spara filen(Saving the file) : Du kan spara projektet i MCD -format. Om du använder alternativet " Exportera " i menyn " (Export)Arkiv(File) " kan du spara ditt projekt i  JPEG-  och  Windows BITMAP-  format.

3] ArgusLab

Bästa gratis molekylära modelleringsprogram ArgusLab

ArgusLab  är en annan användarvänlig programvara för molekylär modellering som kommer med lättförståeliga funktioner. Med denna programvara kan du skapa strukturen för olika kemiska föreningar. På den vänstra panelen i programvaran finns tre flikar tillgängliga:

  • Atomer(Atoms) : Den här fliken innehåller olika element i det periodiska systemet(Periodic Table) . När du klickar på varje atom visar programvaran dess geometri. Klicka(Click) på knappen " Periodiska systemet(Periodic Table) " för att starta det periodiska systemet(Periodic Table) .
  • Ringar(Rings) : Här får du olika typer av kemiska ringstrukturer.
  • Aminosyror(Amino Acids) : Den här fliken visar olika typer av aminosyror. På den här fliken är " Polypeptide Builder " också tillgänglig.

Steg för att rita kemisk förening:

  1. Klicka på fliken " Atom " på den vänstra panelen för att lägga till ett element.
  2. Välj(Select) något av de tillgängliga elementen. Om ditt önskade element inte finns där kan du välja detsamma från " Periodiska systemet(Periodic Table) ."
  3. Använd(Use) högerklicka för att placera elementet på det avsedda utrymmet.
  4. Välj(Select) ett annat element. Välj nu det sista elementet med vänsterklick och placera det andra elementet med högerklick. Detta kommer att förena de två elementen och bilda en förening.
  5. Följ samma steg för att lägga till ringar och aminosyror i utrymmet.

4] Ascalaph Designer

Bästa gratis molekylära modelleringsprogram Ascalaph Designer

Ascalaph Designer  är ytterligare ett bra gratisprogram för molekylär modellering. Det bästa med programvaran är att du inte behöver installera den på din PC. Den kommer med en körbar fil. Programvaran kommer att laddas ner i zip-format. Efter att ha extraherat den hittar du den körbara filen i mappen " bin ".

Steg för att rita en kemisk förening:

  1. Tryck på " Ctrl+N " för att starta ett nytt projekt.
  2. För att lägga till element måste du öppna det periodiska systemet(Periodic Table) . För detta, gå till " Build > Free Drawing ."
  3. Välj(Select) något av elementen och placera dem i utrymmet genom att trycka på tangenterna " Ctrl+Shift ".
  4. Placera ett annat element med hjälp av steget ovan och dra det till det sista elementet för att ansluta dem med en kemisk bindning.

Du kan se varje sammansättning i olika former som  boll och pinne, wireframe, CPK(ball and stick, wireframe, CPK) , etc., genom att klicka på knapparna på den högra panelen. När du väljer ett element från det periodiska systemet(Periodic Table) visar det dig ytterligare information som  elementnamn, hybridisering, kovalent och Van Der Waals attraktionskrafter(element name, hybridization, covalent, and Van Der Waals forces of attraction) . Klicka på menyn " Analysera(Analyze) " för att utföra olika beräkningar, inklusive  energi, temperatur, tryck, dipolmoment(energy, temperature, pressure, dipole moment) , etc.

Spara filen(Saving the file) : Du kan bara spara ditt projekt i dess egna format, inklusive  mim, hin, xmolmmol, smol,  etc. Detta är nackdelen med detta gratisprogram.

Vi hoppas att du tyckte att det här inlägget var användbart för dina skol- och högskoleprojekt.



About the author

Jag är en erfaren mjukvaruingenjör med över 10 års erfarenhet av att utveckla och hantera användarkonton, familjesäkerhet och Google Chrome-teknik. Jag har en stark grund inom matematik och datavetenskap som jag använder för att skapa tydliga, kortfattade beskrivningar av mina färdigheter.



Related posts